Okolice Iwonicza Zdroju zawdzięczają swej budowie geologicznej największe bogactwo, jakim są. wody lecznicze. Wody te stanowiły podstawę założenia i rozwoju uzdrowiska. Ujawniły się one w postaci samoistnych wypływów, które w XIX wieku zostały ujęte w źródła "Karol", "Amelia" i "Józef". Wody z tych ujęć w latach 60. XX wieku uległy demineralizacji a następnie zanikły. Obecnie wody lecznicze eksploatowane są wyłącznie z ujęć wierconych.

Wody iwonickie są wykorzystywane do zabiegów leczniczych: kąpieli mineralnych, inhalacji, kuracji pitnej oraz do wytwarzania produktów uzdrowiskowych.

Posiadają one zróżnicowane parametry fizykochemiczne. W ich składzie występują, miedzy innymi: wodorowęglany, chlorki, jony sodowe, jodkowe, bromkowe, borowe, fluorkowe.

Najbardziej znane wody są dostępne w Pijalni Wód Mineralnych: "Elin 7", "Iwonicz II", "Zofia 6", "Karol 2", "Klimkówka 27", "Iza 19".

Kuracja pitna z zastosowaniem tych wód zalecana jest między innymi w leczeniu choroby wrzodowej żołądka i dwunastnicy, w leczeniu chorób układu moczowego, chorób przemiany materii, niedokrwistości, zaburzeniach czynności dróg żółciowych, niedoczynności tarczycy itp.

Kąpiele mineralne natomiast stosowane są w leczeniu schorzeń ortopedycznych, neurologicznych, reumatologicznych, ginekologicznych. Inhalacje leczą choroby dróg oddechowych. Produkty uzdrowiskowe są otrzymywane w oparciu o wody "Lubatówka 12" i "Lubatówka 14".